summaryrefslogtreecommitdiff
path: root/gnu/packages/bioinformatics.scm
AgeCommit message (Expand)Author
2018-03-03gnu: Add java-biojava-alignment.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (java-biojava-alignment): New variable. Ricardo Wurmus
2018-03-03gnu: Add java-biojava-phylo.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (java-biojava-phylo): New variable. Ricardo Wurmus
2018-03-03gnu: Add java-forester-1.005.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (java-forester-1.005): New variable. Ricardo Wurmus
2018-03-03gnu: Add java-forester.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (java-forester): New variable. Ricardo Wurmus
2018-03-03gnu: Add java-biojava-core.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (java-biojava-core): New variable. Ricardo Wurmus
2018-03-03gnu: Add fastqc.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (fastqc): New variable. Ricardo Wurmus
2018-03-02gnu: cutadapt: Update to 1.16.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (cutadapt): Update to 1.16. [source]: Fetch via git. [arguments]: Remove. [native-inputs]: Replace python-nose with python-pytest. Ricardo Wurmus
2018-03-01gnu: r-scran: Update to 1.6.8.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-scran): Update to 1.6.8. Ricardo Wurmus
2018-03-01gnu: r-wgcna: Update to 1.63.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-wgcna): Update to 1.63. Ricardo Wurmus
2018-03-01gnu: r-topgo: Update to 2.30.1.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-topgo): Update to 2.30.1. Ricardo Wurmus
2018-03-01gnu: r-genomicranges: Update to 1.30.3.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-genomicranges): Update to 1.30.3. Ricardo Wurmus
2018-03-01gnu: r-limma: Update to 3.34.9.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-limma): Update to 3.34.9. Ricardo Wurmus
2018-03-01gnu: r-edger: Update to 3.20.9.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-edger): Update to 3.20.9. Ricardo Wurmus
2018-03-01gnu: r-shortread: Update to 1.36.1.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-shortread): Update to 1.36.1. Ricardo Wurmus
2018-03-01gnu: r-dexseq: Update to 1.24.3.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-dexseq): Update to 1.24.3. Ricardo Wurmus
2018-02-22gnu: r-qtl: Update to 1.42-8.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-qtl): Update to 1.42-8. Ricardo Wurmus
2018-02-19gnu: r-delayedmatrixstats: Update to 1.0.3.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-delayedmatrixstats): Update to 1.0.3. Ricardo Wurmus
2018-02-19gnu: r-scater: Update to 1.6.3.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-scater): Update to 1.6.3. Ricardo Wurmus
2018-02-19gnu: r-gviz: Update to 1.22.3.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-gviz): Update to 1.22.3. Ricardo Wurmus
2018-02-19gnu: r-gprofiler: Update to 0.6.4.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-gprofiler): Update to 0.6.4. Ricardo Wurmus
2018-02-19gnu: r-ensembldb: Update to 2.2.2.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-ensembldb): Update to 2.2.2. Ricardo Wurmus
2018-02-19gnu: r-seurat: Update to 2.2.1.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-seurat): Update to 2.2.1. [propagated-inputs]: Remove r-nmf; add r-metap. Ricardo Wurmus
2018-02-19gnu: r-qtl: Update to 1.42-7.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-qtl): Update to 1.42-7. Ricardo Wurmus
2018-02-19gnu: r-genomicranges: Update to 1.30.2.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-genomicranges): Update to 1.30.2. Ricardo Wurmus
2018-02-19gnu: r-getopt: Update to 1.20.2.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-getopt): Update to 1.20.2. Ricardo Wurmus
2018-02-19gnu: r-bookdown: Update to 0.7.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-bookdown): Update to 0.7. [propagated-inputs]: Add r-tinytex. Ricardo Wurmus
2018-02-18Merge branch 'master' into core-updatesRicardo Wurmus
2018-02-17gnu: vsearch: Update to 2.7.1.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (vsearch): Update to 2.7.1. Ben Woodcroft
2018-02-16Merge branch 'master' into core-updatesMark H Weaver
2018-02-16gnu: diamond: Update to 0.9.18.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (diamond): Update to 0.9.18. Ben Woodcroft
2018-02-15gnu: Add python-loompy.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (python-loompy): New variable. Ricardo Wurmus
2018-02-15gnu: Add r-dropbead.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-dropbead): New variable. Ricardo Wurmus
2018-02-15gnu: Add r-delayedmatrixstats.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-delayedmatrixstats): New variable. Ricardo Wurmus
2018-02-14Merge branch 'master' into core-updatesMark H Weaver
2018-02-14gnu: vsearch: Update to 2.7.0.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (vsearch): Update to 2.7.0. Ben Woodcroft
2018-02-13Merge branch 'master' into core-updatesMark H Weaver
2018-02-13gnu: r-gprofiler: Update to 0.6.3.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-gprofiler): Update to 0.6.3. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-ensembldb: Update to 2.2.1.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-ensembldb): Update to 2.2.1. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-gage: Update to 2.28.2.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-gage): Update to 2.28.2. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-keggrest: Update to 1.18.1.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-keggrest): Update to 1.18.1. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-seurat: Update to 2.2.0.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-seurat): Update to 2.2.0. [propagated-inputs]: Remove r-ggjoy; add r-rcppeigen and r-ggridges. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-msnbase: Update to 2.4.2.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-msnbase): Update to 2.4.2. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-methylkit: Update to 1.4.1.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-methylkit): Update to 1.4.1. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-gkmsvm: Update to 0.79.0.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-gkmsvm): Update to 0.79.0. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-wgcna: Update to 1.62.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-wgcna): Update to 1.62. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-genomation: Update to 1.11.3.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-genomation): Update to 1.11.3. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-genomicfeatures: Update to 1.30.3.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-genomicfeatures): Update to 1.30.3. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-rtracklayer: Update to 1.38.3.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-rtracklayer): Update to 1.38.3. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-summarizedexperiment: Update to 1.8.1.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-summarizedexperiment): Update to 1.8.1. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-biomart: Update to 2.34.2.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-biomart): Update to 2.34.2. Ricardo Wurmus
generated by cgit v1.2.3 (git 2.47.1) at 2025-03-06 23:12:15 +0000