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2018-02-13gnu: r-mass: Update to 7.3-48.•••* gnu/packages/statistics.scm (r-mass): Update to 7.3-48. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-gprofiler: Update to 0.6.3.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-gprofiler): Update to 0.6.3. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-ensembldb: Update to 2.2.1.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-ensembldb): Update to 2.2.1. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-gage: Update to 2.28.2.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-gage): Update to 2.28.2. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-keggrest: Update to 1.18.1.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-keggrest): Update to 1.18.1. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-seurat: Update to 2.2.0.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-seurat): Update to 2.2.0. [propagated-inputs]: Remove r-ggjoy; add r-rcppeigen and r-ggridges. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-msnbase: Update to 2.4.2.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-msnbase): Update to 2.4.2. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-methylkit: Update to 1.4.1.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-methylkit): Update to 1.4.1. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-gkmsvm: Update to 0.79.0.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-gkmsvm): Update to 0.79.0. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-wgcna: Update to 1.62.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-wgcna): Update to 1.62. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-genomation: Update to 1.11.3.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-genomation): Update to 1.11.3. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-genomicfeatures: Update to 1.30.3.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-genomicfeatures): Update to 1.30.3. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-rtracklayer: Update to 1.38.3.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-rtracklayer): Update to 1.38.3. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-summarizedexperiment: Update to 1.8.1.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-summarizedexperiment): Update to 1.8.1. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-biomart: Update to 2.34.2.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-biomart): Update to 2.34.2. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-genomicranges: Update to 1.30.1.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-genomicranges): Update to 1.30.1. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-limma: Update to 3.34.8.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-limma): Update to 3.34.8. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-variantannotation: Update to 1.24.5.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-variantannotation): Update to 1.24.5. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-edger: Update to 3.20.8.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-edger): Update to 3.20.8. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-bookdown: Update to 0.6.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-bookdown): Update to 0.6. [propagated-inputs]: Add r-xfun and ghc-pandoc. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-vegan: Update to 2.4-6.•••* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-vegan): Update to 2.4-6. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-drr: Update to 0.0.3.•••* gnu/packages/cran.scm (r-drr): Update to 0.0.3. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-lava: Update to 1.6.•••* gnu/packages/cran.scm (r-lava): Update to 1.6. [propagated-inputs]: Add r-squarem. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-sp: Update to 1.2-7.•••* gnu/packages/cran.scm (r-sp): Update to 1.2-7. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-proxy: Update to 0.4-21.•••* gnu/packages/cran.scm (r-proxy): Update to 0.4-21. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-hexbin: Update to 1.27.2.•••* gnu/packages/statistics.scm (r-hexbin): Update to 1.27.2. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-dendextend: Update to 1.7.0.•••* gnu/packages/cran.scm (r-dendextend): Update to 1.7.0. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-ddalpha: Update to 1.3.1.1.•••* gnu/packages/cran.scm (r-ddalpha): Update to 1.3.1.1. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-recipes: Update to 0.1.2.•••* gnu/packages/cran.scm (r-recipes): Update to 0.1.2. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-pracma: Update to 2.1.4.•••* gnu/packages/maths.scm (r-pracma): Update to 2.1.4. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: Add r-uuid.•••* gnu/packages/cran.scm (r-uuid): New variable. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: Add r-pillar.•••* gnu/packages/cran.scm (r-pillar): New variable. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: Add r-utf8.•••* gnu/packages/cran.scm (r-utf8): New variable. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: Add r-squarem.•••* gnu/packages/cran.scm (r-squarem): New variable. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-shape: Update to 1.4.4.•••* gnu/packages/cran.scm (r-shape): Update to 1.4.4. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-rcpp: Update to 0.12.15.•••* gnu/packages/cran.scm (r-rcpp): Update to 0.12.15. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: Add r-xfun.•••* gnu/packages/cran.scm (r-xfun): New variable. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: unzip: Mitigate CVE-2018-1000035.•••* gnu/packages/compression.scm (unzip)[replacement]: New field. (unzip/fixed): New variable. Leo Famulari
2018-02-13gnu: Add ghc-megaparsec.•••* gnu/packages/haskell.scm (ghc-megaparsec): New variable. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: Add ghc-parser-combinators.•••* gnu/packages/haskell.scm (ghc-parser-combinators): New variable. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: Add ghc-text-binary.•••* gnu/packages/haskell.scm (ghc-text-binary): New variable. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: ghc-trifecta: Update to 1.7.1.1.•••* gnu/packages/haskell.scm (ghc-trifecta): Update to 1.7.1.1. [inputs]: Add ghc-doctest. [native-inputs]: Add cabal-doctest. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: ghc-reducers: Update to 3.12.2.•••* gnu/packages/haskell.scm (ghc-reducers): Update to 3.12.2. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: ghc-directory: Add note.•••* gnu/packages/haskell.scm (ghc-directory): Add comment not to use this package as an input. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: darcs: Update to 2.12.5.•••* gnu/packages/version-control.scm (darcs): Update to 2.12.5. [arguments]: Relax version constraint on shelly. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: darcs: Remove ghc-directory from inputs.•••* gnu/packages/version-control.scm (darcs)[inputs]: Remove ghc-directory. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: ghc-graphviz: Fix build with newer QuickCheck.•••* gnu/packages/haskell.scm (ghc-graphviz)[arguments]: Allow building with newer QuickCheck. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: ghc-tar: Disable tests.•••* gnu/packages/haskell.scm (ghc-tar)[arguments]: Disable tests. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: ghc-system-filepath: Update to 0.4.14.•••* gnu/packages/haskell.scm (ghc-system-filepath): Update to 0.4.14. [arguments]: Disable tests. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: darcs: Remove ghc-process from inputs.•••* gnu/packages/version-control.scm (darcs)[inputs]: Remove ghc-process. Ricardo Wurmus