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2018-03-03gnu: Add java-picard-2.10.3....* gnu/packages/bioinformatics.scm (java-picard-2.10.3): New variable. Ricardo Wurmus
2018-03-03gnu: Add java-htsjdk-2.10.1....* gnu/packages/bioinformatics.scm (java-htsjdk-2.10.1): New variable. Ricardo Wurmus
2018-03-03gnu: Add java-htsjdk-latest....* gnu/packages/bioinformatics.scm (java-htsjdk-latest): New variable. Ricardo Wurmus
2018-03-03gnu: Add java-biojava-alignment-4.0....* gnu/packages/bioinformatics.scm (java-biojava-alignment-4.0): New variable. Ricardo Wurmus
2018-03-03gnu: Add java-biojava-phylo-4.0....* gnu/packages/bioinformatics.scm (java-biojava-phylo-4.0): New variable. Ricardo Wurmus
2018-03-03gnu: Add java-biojava-core-4.0....* gnu/packages/bioinformatics.scm (java-biojava-core-4.0): New variable. Ricardo Wurmus
2018-03-03gnu: Add java-biojava-alignment....* gnu/packages/bioinformatics.scm (java-biojava-alignment): New variable. Ricardo Wurmus
2018-03-03gnu: Add java-biojava-phylo....* gnu/packages/bioinformatics.scm (java-biojava-phylo): New variable. Ricardo Wurmus
2018-03-03gnu: Add java-forester-1.005....* gnu/packages/bioinformatics.scm (java-forester-1.005): New variable. Ricardo Wurmus
2018-03-03gnu: Add java-forester....* gnu/packages/bioinformatics.scm (java-forester): New variable. Ricardo Wurmus
2018-03-03gnu: Add java-biojava-core....* gnu/packages/bioinformatics.scm (java-biojava-core): New variable. Ricardo Wurmus
2018-03-03gnu: Add fastqc....* gnu/packages/bioinformatics.scm (fastqc): New variable. Ricardo Wurmus
2018-03-02gnu: cutadapt: Update to 1.16....* gnu/packages/bioinformatics.scm (cutadapt): Update to 1.16. [source]: Fetch via git. [arguments]: Remove. [native-inputs]: Replace python-nose with python-pytest. Ricardo Wurmus
2018-03-01gnu: r-scran: Update to 1.6.8....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-scran): Update to 1.6.8. Ricardo Wurmus
2018-03-01gnu: r-wgcna: Update to 1.63....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-wgcna): Update to 1.63. Ricardo Wurmus
2018-03-01gnu: r-topgo: Update to 2.30.1....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-topgo): Update to 2.30.1. Ricardo Wurmus
2018-03-01gnu: r-genomicranges: Update to 1.30.3....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-genomicranges): Update to 1.30.3. Ricardo Wurmus
2018-03-01gnu: r-limma: Update to 3.34.9....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-limma): Update to 3.34.9. Ricardo Wurmus
2018-03-01gnu: r-edger: Update to 3.20.9....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-edger): Update to 3.20.9. Ricardo Wurmus
2018-03-01gnu: r-shortread: Update to 1.36.1....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-shortread): Update to 1.36.1. Ricardo Wurmus
2018-03-01gnu: r-dexseq: Update to 1.24.3....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-dexseq): Update to 1.24.3. Ricardo Wurmus
2018-02-22gnu: r-qtl: Update to 1.42-8....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-qtl): Update to 1.42-8. Ricardo Wurmus
2018-02-19gnu: r-delayedmatrixstats: Update to 1.0.3....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-delayedmatrixstats): Update to 1.0.3. Ricardo Wurmus
2018-02-19gnu: r-scater: Update to 1.6.3....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-scater): Update to 1.6.3. Ricardo Wurmus
2018-02-19gnu: r-gviz: Update to 1.22.3....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-gviz): Update to 1.22.3. Ricardo Wurmus
2018-02-19gnu: r-gprofiler: Update to 0.6.4....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-gprofiler): Update to 0.6.4. Ricardo Wurmus
2018-02-19gnu: r-ensembldb: Update to 2.2.2....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-ensembldb): Update to 2.2.2. Ricardo Wurmus
2018-02-19gnu: r-seurat: Update to 2.2.1....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-seurat): Update to 2.2.1. [propagated-inputs]: Remove r-nmf; add r-metap. Ricardo Wurmus
2018-02-19gnu: r-qtl: Update to 1.42-7....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-qtl): Update to 1.42-7. Ricardo Wurmus
2018-02-19gnu: r-genomicranges: Update to 1.30.2....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-genomicranges): Update to 1.30.2. Ricardo Wurmus
2018-02-19gnu: r-getopt: Update to 1.20.2....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-getopt): Update to 1.20.2. Ricardo Wurmus
2018-02-19gnu: r-bookdown: Update to 0.7....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-bookdown): Update to 0.7. [propagated-inputs]: Add r-tinytex. Ricardo Wurmus
2018-02-18Merge branch 'master' into core-updatesRicardo Wurmus
2018-02-17gnu: vsearch: Update to 2.7.1....* gnu/packages/bioinformatics.scm (vsearch): Update to 2.7.1. Ben Woodcroft
2018-02-16Merge branch 'master' into core-updatesMark H Weaver
2018-02-16gnu: diamond: Update to 0.9.18....* gnu/packages/bioinformatics.scm (diamond): Update to 0.9.18. Ben Woodcroft
2018-02-15gnu: Add python-loompy....* gnu/packages/bioinformatics.scm (python-loompy): New variable. Ricardo Wurmus
2018-02-15gnu: Add r-dropbead....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-dropbead): New variable. Ricardo Wurmus
2018-02-15gnu: Add r-delayedmatrixstats....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-delayedmatrixstats): New variable. Ricardo Wurmus
2018-02-14Merge branch 'master' into core-updatesMark H Weaver
2018-02-14gnu: vsearch: Update to 2.7.0....* gnu/packages/bioinformatics.scm (vsearch): Update to 2.7.0. Ben Woodcroft
2018-02-13Merge branch 'master' into core-updatesMark H Weaver
2018-02-13gnu: r-gprofiler: Update to 0.6.3....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-gprofiler): Update to 0.6.3. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-ensembldb: Update to 2.2.1....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-ensembldb): Update to 2.2.1. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-gage: Update to 2.28.2....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-gage): Update to 2.28.2. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-keggrest: Update to 1.18.1....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-keggrest): Update to 1.18.1. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-seurat: Update to 2.2.0....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-seurat): Update to 2.2.0. [propagated-inputs]: Remove r-ggjoy; add r-rcppeigen and r-ggridges. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-msnbase: Update to 2.4.2....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-msnbase): Update to 2.4.2. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-methylkit: Update to 1.4.1....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-methylkit): Update to 1.4.1. Ricardo Wurmus
2018-02-13gnu: r-gkmsvm: Update to 0.79.0....* gnu/packages/bioinformatics.scm (r-gkmsvm): Update to 0.79.0. Ricardo Wurmus
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